Juan Antonio Bayona (ur. 9 maja 1975 w Barcelonie) − hiszpański reżyser i scenarzysta filmowy, pracujący przeważnie za granicą. Specjalista od kina gatunkowego. Reżyseruje także teledyski i reklamy telewizyjne.
Autor głośnego horroru Sierociniec (2007), za który otrzymał w 2008 nagrodę Goya dla najlepszego debiutującego reżysera. Po sukcesie filmu, Bayona zaczął tworzyć wysokobudżetowe hollywoodzkie produkcje w języku angielskim. Nakręcił film katastroficzny Niemożliwe (2012) o przebiegu tsunami z 2004 r. oraz film fantasy Siedem minut po północy (2016). Za wszystkie trzy wymienione obrazy otrzymał nagrody Goya, najwyższe wyróżnienie hiszpańskiego przemysłu filmowego.
Był reżyserem piątej części cyklu Park jurajski – Jurassic World: Upadłe królestwo (2018).