Jonathan Pitroipa (ur. 12 kwietnia 1986 w Wagadugu) − burkiński piłkarz występujący na pozycji pomocnika. Od 2018 jest zawodnikiem klubu Royal Antwerp FC.
Pitroipa karierę rozpoczynał w Planète Champion Wagadugu. W 2004 roku trafił do niemieckiego SC Freiburg. W barwach tego zespołu zadebiutował 23 kwietnia 2005 w przegranym przez jego zespół 1-3 pojedynku z Arminią Bielefeld, rozegranym w ramach rozgrywek ekstraklasy. Przez cały sezon 2004/05 rozegrał cztery ligowe spotkania, a jego drużyna zajęła ostatnią, osiemnastą pozycję w lidze i została zdegradowana do drugiej ligi. Pitroipa postanowił jednak pozostać w klubie. Na zapleczu ekstraklasy strzelił pierwszego gola w profesjonalnej karierze. Było to w ligowym meczu ze Sportfreunde Siegen, rozegranym 23 kwietnia 2006 i zakończonym wynikiem 2-2. W ciągu całego sezonu, w którym był głównie rezerwowym, wystąpił w lidze czternaście razy i zdobył jedną bramkę. Od początku sezonu 2006/07 był podstawowym zawodnikiem składu Freiburga. Łącznie dla tego klubu zagrał 75 razy i strzelił 16 goli.