Thomas Morgenstern (Spittal an der Drau, 30 oktober 1986) is een voormalige Oostenrijkse schansspringer. Het grootste succes haalde hij tijdens de Olympische Winterspelen 2006 in Turijn. Op de kleine schans kwam hij niet verder dan de 9e plaats, maar op de K120-schans won hij het goud, slechts één-tiende punt voor zijn landgenoot Andreas Kofler.
Morgenstern was een van de grootste natuurtalenten in de schansspringsport. Tijdens het Vierschansentoernooi van 2002/2003 brak hij definitief door in het internationale veld, door zich bij de topspringers te melden. Hij werd 9e in Oberstdorf, 25e in Garmisch-Partenkirchen, 9e in Innsbruck en 6e in Bischofshofen. Vijf dagen na het einde van het toernooi boekte hij zijn eerste wereldbekerzege in het Tsjechische Liberec.
In het seizoen 2003/2004 consolideerde hij zijn plek in de wereldtop. Tijdens het Vierschansentoernooi eindigde hij slechts drie plaatsen achter winnaar Sigurd Pettersen op de vierde plaats.