Pedro Francisco Duque Duque (Madrid, 14 maart 1963) is een Spaans ruimtevaarder van de ESA. Duque zijn eerste ruimtevlucht was STS-95 met de spaceshuttle Discovery en vond plaats op 29 oktober 1998. Tijdens de missie werden er aan boord verschillende experimenten uitgevoerd.
In totaal heeft Duque twee ruimtevluchten op zijn naam staan, allemaal naar het Internationaal ruimtestation ISS. Daar voerde hij ook de Cervantes-missie uit. Hij was lid van het Europees astronautenkorps.