Morten Wieghorst (Glostrup, 25 februari 1971) is een Deens voetbaltrainer en voormalig voetballer. Hij is momenteel zonder club nadat hij werd ontslagen in november 2018 bij Aalborg BK
Morten Wieghorst maakte in 1989 zijn debuut in het profvoetbal voor Lyngby BK. Met die club wist hij in 1990 beslag te leggen op de Deense beker. Twee jaar later maakte hij de overstap naar Dundee United. Hij behaalde met Dundee in 1995 de finale van de Scottish League Cup waar de club werd verslagen door Aberdeen FC. In december 1995 maakte hij de overstap naar het grotere Celtic FC. Wieghorst sukkelde tijdens zijn eerste twee seizoenen in Glasgow met veel blessures. In 1998 had hij een belangrijk aandeel in het winnen van het landskampioenschap met Celtic. In 2000 werd er bij Wieghorst het Syndroom van Guillain-Barré geconstateerd en daarne werd hij een jaar lang behandeld. In 2002 keerde Wieghorst terug naar Denemarken, hij ging nu voor Brøndby IF spelen. In 2005 stopte hij met voetballen.