Juan Sebastián Agudelo (Manizales, 23 november 1992) is een Amerikaans-Colombiaans voetballer die bij voorkeur als aanvaller speelt. In 2015 tekende hij een contract bij New England Revolution.
Op achtjarige leeftijd kwam hij naar de Verenigde Staten. Op 26 maart 2010 tekende Agudelo een profcontract bij New York Red Bulls. Daarvoor speelde hij ook in de jeugdacademie van de club. Echter ontving Agudelo ook een aanbieding van het Colombiaanse Millonarios. Agudelo vloog zelf naar Colombia en speelde mee met het het tweede elftal van de Colombiaanse topclub. Uiteindelijk verkoos Agudelo toch een carrière in de Major League Soccer. Hij debuteerde op 27 april 2010 in de US Open Cup tegen Philadelphia Union. Zijn debuut in de MLS had plaats op 9 oktober 2010 tegen Real Salt Lake. Op 19 maart 2011 maakte hij zijn eerste doelpunt voor New York Red Bulls tegen Seattle Sounders.
Op 16 november 2011 trainde Agudelo twee weken mee bij VfB Stuttgart. Op 1 december 2011 deed hij een gelijkaardige stage bij Liverpool.