Jonas Meffert (Keulen, 4 september 1994) is een Duits voetballer die doorgaans als middenvelder speelt. In juli 2018 verruilde hij SC Freiburg voor Holstein Kiel.
Meffert kwam op tienjarige leeftijd naar Bayer Leverkusen. Hij debuteerde in het eerste elftal in november 2012, in een wedstrijd in de Europa League tegen het Oekraïense Metalist Charkov. Voor Metalist troffen Jonathan Cristaldo en Cleiton Xavier doel en Leverkusen zou niet tot scoren komen dit duel. Meffert maakte na vijfenzestig minuten zijn entree in deze wedstrijd, toen hij van coach Sascha Lewandowski mocht invallen voor Stefan Reinartz. Bij dit ene optreden voor Bayer Leverkusen zou het uiteindelijk blijven. In de zomer van 2014 verkaste Meffert transfervrij naar Karlsruher SC, waar hij zijn handtekening zette onder een driejarig contract. Twee seizoenen lang was hij overwegend basisspeler in Karlsruhe. Na deze twee jaren werd hij voor zeshonderdduizend euro teruggekocht door Leverkusen, dat een terugkoopoptie had afgedwongen. Voor het dubbele bedrag, circa 1,2 miljoen euro, werd hij hierop weer overgenomen door SC Freiburg. Begin 2017 werd Meffert voor een halfjaar op huurbasis bij Karlsruher SC gestald. In juli 2018 maakte Meffert de overstap naar Holstein Kiel.