Javier ("El Vasco") Aguirre Onaindia (Mexico-Stad, 1 december 1958) is een Mexicaanse voetbaltrainer en voormalig voetballer.
Aguirre debuteerde in 1978 in het eerste elftal van Club América in de Mexicaanse voetbalcompetitie. In 1986 was hij tijdens het wereldkampioenschap in eigen land actief als speler van het Mexicaanse voetbalelftal. Hij gaf de voorzet waaruit Manuel Negrete een doelpunt maakte dat in 2018 werd verkozen tot 'greatest goal' uit de WK-geschiedenis. Aguirre kwam eveneens uit voor Osasuna in de Spaanse competitie, maar keerde begin jaren negentig terug naar Mexico bij Chivas Guadalajara waarna hij niet veel later stopte met voetballen.
Aguirre stopte met voetballen nadat hij een uitnodiging had gekregen van de toenmalige bondscoach Miguel Mejía Barón om als assistent mee te gaan naar het wereldkampioenschap voetbal in de Verenigde Staten in 1994. Daarna assisteerde hij Barón bij de Mexicaanse voetbalclub CF Atlante. In 1998 kreeg hij bij Pachuca een baan aangeboden als trainer om de club te behoeden voor degradatie. Dit lukte en een jaar later wist hij de club zelfs de eerste titel te schenken in de geschiedenis.