Jan Koller (Smetanova Lhota, 30 maart 1973) is een gewezen Tsjechische voetballer. Hij speelde als spits en viel op door zijn lengte (2,02 m). Hij was naast een goed balkaatser ook een kopbalspecialist. In 2000 kreeg hij de Belgische Gouden Schoen.
Hij werd in 1997 uit Tsjechië weggeplukt door Lokeren. Bij deze club werd hij topscorer in het seizoen 1998/99. Na twee succesvolle seizoenen trok hij in 1999 naar RSC Anderlecht. Hier won hij twee landstitels. Zijn hoogtepunt was het behalen van de tweede ronde van de Champions League na groepswinst in een poule met Dynamo Kiev, Manchester United en PSV in 2000/01. Na dat wervelende seizoen (2000/01) versierde Koller een transfer naar het Duitse Borussia Dortmund waar hij zijn Tsjechisch maatje Tomáš Rosický aantrof. Gedurende vijf jaar speelde hij er 137 wedstrijden en daarin scoorde hij 59 maal. In het seizoen 2001/02 speelde Borussia Dortmund op de laatste speeldag kampioen op het veld van Werder Bremen, Koller scoorde de gelijkmaker en Ewerthon het winnende doelpunt. In hetzelfde seizoen scoorde Koller op 8 mei het laatste doelpunt van de met 3-2 verloren finale van de UEFA Cup tegen Feyenoord in De Kuip te Rotterdam.