Fabian Lustenberger (Nebikon, 2 mei 1988) is een Zwitsers voetballer die bij voorkeur als defensieve middenvelder speelt. Hij verruilde in 2008 FC Luzern voor Hertha BSC, waar hij uitgroeide tot aanvoerder.
Lustenberger werd op zeventienjarige leeftijd bij het eerste elftal van FC Luzern gehaald. Hij werkte zich al snel op tot basisspeler. Na 35 competitiewedstrijden in het shirt van Luzern vertrok hij op 10 augustus 2007 naar Hertha BSC, dat anderhalf miljoen euro veil had voor de defensieve middenvelder. In zijn eerste seizoen speelde hij 24 wedstrijden in de Bundesliga. In december 2007 scoorde hij zijn eerste doelpunt in de Bundesliga tegen FC Nürnberg. Hij bleef de club trouw toen ze in 2010 en 2012 naar de 2. Bundesliga degradeerden. In 2013 steeg Hertha BSC opnieuw naar de Bundesliga. Op 2 augustus 2013 werd hij aangeduid als nieuwe aanvoerder. Hij nam de aanvoerdersband over van Peter Niemeyer.