Alyson Lee Hannigan (Washington D.C., 24 maart 1974) is een Amerikaans televisie- en filmactrice. Ze speelde onder meer van 1997 tot en met 2003 een vaste rol in de televisieserie Buffy the Vampire Slayer, waarvoor ze in 2003 een Saturn Award won. Van 2005 tot 2014 behoorde ze tot de vaste cast van de serie How I Met Your Mother. Hannigan speelde filmrollen in onder meer American Pie. American Pie 2 en American Wedding.
Hannigan werd al jong bekend door verschillende reclamespotjes waarin ze meespeelde, onder meer voor McDonald's, SixFlags en Oreos. Daarnaast had ze gastrollen in series als Roseanne en Touched by an Angel. Ze speelde in 1988 in My Stepmother is an Alien een hoofdrol als dochter van Dan Aykroyd, twee jaar na haar filmdebuut in Impure Thoughts.
In 1997 begon Hannigan aan de rol van Willow Rosenberg in de televisieserie Buffy the Vampire Slayer waarvoor ze $250.000 per aflevering verdiende. Hiervan maakte ze alle zeven (samen met Sarah Michelle Gellar) seizoenen mee. Sinds 2005 speelt ze opnieuw een vaste rol in een televisieserie als Lily Aldrin in de sitcom How I Met Your Mother.