Stefan Frei (Altstätten, 20 aprile 1986) è un calciatore svizzero naturalizzato statunitense, portiere dei Seattle Sounders FC.
È cugino di Alexander Frei.
Nel 2009 esordisce in Mls con Toronto FC e in cinque stagioni vince quattro volte il Canadian Championship. Nel 2014 passa ai Seattle Sounders dove al primo anno vince subito il Supporters' Shield e la U.S. Open Cup; il 10 dicembre 2016 vince il suo primo titolo di MLS ed è eletto come MVP della finalegrazie ad un intervento prodigioso su Jozy Altidore.