Sean Patrick Flanery (Lake Charles, 11 ottobre 1965) è un attore statunitense, noto soprattutto per il ruolo di Indiana Jones nella serie tv Le avventure del giovane Indiana Jones.
Nato in Louisiana è però cresciuto a Houston, in Texas, dove ha studiato alla Awty International School e alla Dulles High School, inoltre ha frequentato la University of St. Thomas. Flanery iniziò a recitare al college, dopo essersi iscritto ad un corso di recitazione per incontrare una ragazza per la quale aveva una cotta. In seguito si trasferì a Los Angeles, in California, per perseguire la sua carriera da attore.
Acquista popolarità verso gli inizi degli anni novanta interpretando la parte dell'adolescente Indiana Jones nella serie televisiva Le avventure del giovane Indiana Jones, andata in onda tra il 1992 e il 1993, in seguito ha sempre interpretato Indiana Jones in svariati film TV tratti dalla serie.