Jonas Omlin, né le 10 janvier 1994 à Sarnen, est un footballeur suisse qui évolue au poste de gardien de but au FC Bâle.
Né le 10 janvier 1994 à Sarnen dans le canton d'Obwald, Jonas Omlin fait ses débuts dans le club de sa commune natale, avant d’être intégré, dès 2002, au Team Obwald nouvellement créé afin de réunir les meilleurs talents de ce canton. Il rejoint ensuite rapidement le mouvement junior du FC Lucerne, où il effectue sa formation footballistique, avant de rejoindre en 2012 le SC Kriens, alors pensionnaire de troisième division suisse. Après deux saisons, il revient à Lucerne, d’abord en tant que troisième gardien derrière David Zibung et Lorenzo Bucchi. Il fait ses débuts en Super League en mars 2015 lors d’une rencontre face à Bâle, puis est prêté une saison au FC Le Mont-sur-Lausanne en Challenge League. Il revient ensuite à la Swissporarena et s’installe progressivement, dès le mois de mars 2017, en tant que titulaire aux yeux de Markus Babbel, puis de Gerardo Seoane, délogeant ainsi Zibung.