Johan Bruyneel (né le 23 août 1964 à Izegem) est un coureur cycliste et dirigeant d'équipes cyclistes belge. Coureur professionnel de 1987 à 1998, il a notamment été vainqueur d'étapes du Tour de France et du Tour d'Espagne et s'est classé troisième du Tour d'Espagne 1995.
Après sa carrière de coureur, il est devenu directeur de l'équipe US Postal Service (plus tard connu sous le nom de Discovery Channel), une équipe cycliste basée aux États-Unis avec comme leader Lance Armstrong. Sous la direction de Bruyneel, Armstrong a remporté sept fois le Tour de France, avant d'être disqualifié plusieurs années après les succès, pour avoir mis au point le programme de dopage le plus sophistiqué de l'histoire du sport. Après la saison 2007, l'équipe s'est dissoute et Bruyneel a rejoint au même poste l'équipe Astana, avec qui, il a remporté des victoires dans chacun des grands tours avec le coureur espagnol Alberto Contador.