Hendrik Pekeler (Itzehoe, 2 de julio de 1991) es un jugador de balonmano alemán que puede jugar tanto de central como de pívot, y su equipo actual es el THW Kiel de la Bundesliga y en la Selección de balonmano de Alemania.
Con la selección ha ganado el Campeonato Europeo de Balonmano Masculino de 2016 y el bronce en los Juegos Olímpicos de Rio de Janeiro de 2016.