Fabian Lustenberger (Nebikon, Suiza, 2 de mayo de 1988) es un futbolista suizo que actualmente milita en el BSC Young Boys de la Superliga de Suiza. Juega como mediocampista central defensivo además de poder desempeñarse como defensa central. Es internacional con la selección de fútbol de Suiza.
En su primera temporada 2005-2006 para el FC Luzern, Lustenberger logró asentarse en la Raiffeisen Super League e integrarse dentro del equipo. Con el correr de los partidos comenzó a progesar en su nivel futbolístico lo que le permitió ganarse cada vez más la confianza de su técnico el ex-futbolista suizo Ciriaco Sforza, y ya durante el receso invernal, se había ganado un puesto entre los once titulares del plantel.
En agosto de 2007, Lustenberger llegó al equipo de la capital alemana por la cifra de 1,5 millones de euros para disputar la temporada 1. Bundesliga 2007/08. En su primera campaña con el Hertha, disputó 24 partidos en la liga. Sin embargo, durante su primer año no logró establecerse como titular habitual en el equipo, no fue así hasta que en las dos temporadas siguientes disputara 37 partidos y se quedara en el Hertha BSC cuando el club fue relegado a segunda división.