Fabian Frei (Frauenfeld, 8 de enero de 1989) es un futbolista suizo. Juega de centrocampista por derecha y su actual equipo es el F. C. Basilea de la Superliga de Suiza.
Se formó en las divisiones menores del FC Winterthur. Posteriormente pasó al F. C. Basilea, donde jugó en la categoría Sub-21 entre el 2005 y el 2007. En ese año comenzó a jugar en el primer equipo. Su gran momento fue cuando ganaron la Copa Suiza en 2008. En julio de 2009 fue cedido a préstamo al St. Gallen, donde se mantuvo por dos años. Regresó al Basel para la temporada 2011/12. Sus buenas actuaciones en la Axpo Super Lig y la UEFA Champions League han llevado a numerosos clubes a que se interesen en él, entre ellos el Manchester United FC y el Arsenal FC, también el FC Bayern de Múnich y la AS Roma.
Debutó con la selección de fútbol de Suiza en 2011 jugando contra Inglaterra, ingresando los últimos tres minutos de descuento del partido que quedaría empatado 2-2.