Cristian Bonilla (Manizales, Colombia; 2 de junio de 1993) es un futbolista colombiano. Juega de guardameta.
Bonilla inició toda su carrera en el club Once Caldas del cual formó parte de todas las categorías inferiores, pero posteriormente decidió emigrar hacia Europa en busca de oportunidades y tras no tener éxito en el Manchester City de Inglaterra, decidió volver a Colombia y allí fue acogido por el Boyacá Chicó de Tunja.
Su primer club fue el Boyacá Chicó de Tunja donde debutó muy joven en la Copa Colombia. Esto le sirvió para ser convocado a micro-ciclos de la Selección de fútbol de Colombia Sub-15 y Sub-17, ganándose el puesto de titular en la segunda. Luego de disputar siete partidos con su equipo en el Torneo Apertura 2010 de Colombia, el máximo accionista del Boyacá Chicó anuncia su traspaso al club inglés Manchester City. No obstante, no se concreta su traspaso al club inglés