Tomáš Koubek (* 26. August 1992 in Hradec Králové, Tschechoslowakei) ist ein tschechischer Fußballtorhüter, der seit 2016 für die Tschechische Republik und seit 2017 beim französischen Erstligisten Stade Rennes spielt. Zuvor stand er beim tschechischen Rekordmeister Sparta Prag unter Vertrag, wurde aber zeitweise an den Ligakonkurrenten Slovan Liberec verliehen.
Koubek begann bei seinem Heimatverein FC Hradec Králové, der 2010 in die erste Liga aufgestiegen war. In seiner ersten Saison kam er nur zu zwei Einsätzen und hatte damit wenig Anteil daran, dass der Neuling die Klasse halten konnte. In der nächsten Saison kam er dann schon zu 13 Ligaeinsätzen, in denen er viermal ohne Gegentor blieb. Erneut konnte die Klasse gehalten werden, wenn auch knapper als zuvor. 2012/13 blieb er in 20 Ligaspielen viermal ohne Gegentor, stieg mit seiner Mannschaft aber als Tabellenletzter ab. In der darauf folgenden Zweitligasaison blieb er in 13 Spielen sechsmal ohne Gegentor und stieg als Vizemeister wieder in die erste Liga auf. Dort blieb er in 26 Spielen wieder sechsmal ohne Gegentor, stieg aber als Tabellenvorletzter sofort wieder ab.