Naser Aliji (* 27. Dezember 1993 in Skopje, Mazedonien) ist ein albanischer Fussballspieler, der auch die Schweizer und die nordmazedonische Staatsbürgerschaft besitzt. Er spielt hauptsächlich auf der Position des linken Aussenverteidigers.
Aliji wurde in Skopje, Mazedonien, als Sohn von Eltern aus der albanischen Minderheit geboren. Er lebte dort, bis er vier Jahre alt war und zog dann mit seiner Mutter in die Schweiz. Dort begann er mit dem Fußballspielen beim FC Baden. Im Alter von neun Jahren ging er zum FC Aarau und schloss sich im Jahr 2008 dem FC Basel an. Für den FC Basel gab Aliji sein Debüt in der Super League am 16. März 2014 im Spiel gegen den FC Aarau (5:0). Am 15. Januar 2015 wurde er an den FC Vaduz verliehen. Nach dem Ende der Saison wurde die Leihe verlängert. Während der Saison 2015/16 verletzten sich die beiden Linksverteidiger des FC Basel, sodass er vorzeitig zurückgeholt wurde. Unter Trainer Urs Fischer gewann Aliji am Ende der Saison 2015/16 zum dritten Mal den Meistertitel mit dem FCB.