Makoto Shinkai (jap. 新海 誠, Shinkai Makoto; * 9. Februar 1973 in Kuomi, Präfektur Nagano, Japan; gebürtig Makoto Niitsu (新津 誠, Niitsu Makoto)) ist ein japanischer Anime-Regisseur und Animator. Er studierte japanische Literatur.
Im Jahre 1999 veröffentlichte Shinkai mit Kanojo to Kanojo no Neko einen fünfminütigen Kurzfilm in schwarzweiß. Dieser wurde mehrfach ausgezeichnet, unter anderem mit dem Großen Preis beim DoGA CG Animations-Wettbewerb 2000. Der Kurzfilm thematisiert das Leben einer Katze aus deren Perspektive, das sie mit ihrer Besitzerin, einer jungen Frau, verbringt.
Danach arbeitete er als Grafikdesigner für den Videospiel-Produzenten Falcom. Ab Juni 2000 arbeitete er an Voices of a Distant Star (Hoshi no Koe), das er in etwa sieben Monaten umsetzte und mit seiner Verlobten Mika Shinohara (篠原 美香, Shinohara Mika) synchronisierte – aber später professionell neusynchronisiert wurde.