Jonathan Bernier (* 7. August 1988 in Laval, Québec) ist ein kanadischer Eishockeytorwart, der seit Juli 2018 bei der Detroit Red Wings in der National Hockey League unter Vertrag steht.
Jonathan Bernier begann seine Karriere 2004 bei den Lewiston MAINEiacs aus der Ligue de hockey junior majeur du Québec. Dort war er in seiner ersten Saison der Back-up-Torwart hinter Jaroslav Halák und kam auf insgesamt 23 Einsätze. In seinem zweiten Jahr nahm er die Position des Stammtorhüters ein und verbuchte insgesamt 27 Siege.
Nach dem Ende der Saison kam er im April 2006 bei der U18-Weltmeisterschaft für das Team Kanada zum Einsatz. Bernier absolvierte alle Spiele für das Team und verbuchte einen guten Gegentorschnitt von 1,71 bei einer Fangquote von 94,3 Prozent. Allerdings scheiterte Kanada im Halbfinale an Finnland und musste sich nach einer weiteren Niederlage im Spiel um die Bronzemedaille mit dem vierten Platz zufriedengeben.