John Harbaugh (* 23. September 1962 in Toledo, Ohio) ist ein US-amerikanischer American-Football-Trainer. Er ist der Head Coach der Baltimore Ravens in der National Football League (NFL).
John Harbaugh ist der Sohn von Jack Harbaugh, einem langjährigen College-Football-Trainer. Sein Bruder Jim Harbaugh spielte als Quarterback unter anderem bei den Indianapolis Colts und war von 2011 bis 2014 Head Coach der San Francisco 49ers. John spielte als Defensive Back Football an der Miami University für die Miami RedHawks.
John Harbaugh wurde nach seinem Studium Trainerassistent an seinem College. Er war bei den RedHawks für das Training der Defensive Backs verantwortlich. Ab 1984 trainierte er für drei Jahre die Runningbacks der Western Michigan University bevor er 1987 zur University of Pittsburgh wechselte und dort die Tight Ends betreute. Als Trainer der Special Teams fungierte er 1988 an der Morehead State University. Als Special-Teams-Coordinator betreute er von 1989 bis 1996 die Mannschaft der University of Cincinnati und 1997 die der Indiana University.