Jan Jacobus Wouters (* 17. Juli 1960 in Utrecht) ist ein niederländischer Fußballtrainer und ehemaliger Fußballspieler.
Mit 20 Jahren erhielt Wouters einen Lizenzspielervertrag beim Erstligisten FC Utrecht, seinem Heimatverein. Bereits im ersten Jahr kam der Mittelfeldspieler zu regelmäßigen Einsätzen und mit dem dritten Platz am Ende der Saison erreichte er mit seiner Mannschaft die bis heute beste Platzierung. Im Folgejahr setzte er sich endgültig durch und wurde Stammspieler. 1985 konnte er mit dem Team seinen ersten nationalen Titel, den KNVB-Pokal, gewinnen. Im Sommer 1986 wurde er von dem niederländischen Spitzenverein Ajax Amsterdam abgeworben. Dort wurde Wouters auf Anhieb Stammspieler und Leistungsträger. 1990 – vier Jahre lang ohne Meistertitel – wurde dieser gewonnen. Im selben Jahr wurde er Fußballer des Jahres der Niederlande. Im Herbst 1991 kehrte Wouters der Ehrendivision den Rücken und wechselte ins Ausland. In Deutschland unterzeichnete er beim FC Bayern München, für den er zwei Jahre aktiv war. Sein Bundesliga-Debüt gab er am 23. November 1991 (19. Spieltag) beim 1:0-Heimsieg über den Karlsruher SC. Drei Spieltage später erzielte er seinen ersten Ligatreffer im Trikot der Münchner. Beim 3:1-Heimsieg am 14. Dezember gegen Fortuna Düsseldorf erzielte Wouters den 2:1-Führungstreffer. In der Folgesaison bestritt Wouters 33 Spiele und traf viermal. Nach Ablauf der Saison 1993/94 wurden die Bayern Deutscher Meister. Wouters war allerdings bereits zur Winterpause, nach 16 Spielen (1 Tor), zur PSV Eindhoven gewechselt. Mit der PSV wurde Wouters nochmals Niederländischer Pokalsieger und beendete schließlich 1996 seine aktive Laufbahn.