Jan Koller (* 30. März 1973 in Smetanova Lhota) ist ein ehemaliger tschechischer Fußballspieler.
Nach dem Beginn in der Jugend bei LhotaTJ Smetanova Lhota, ein Verein aus seiner Heimatstadt, und ZVVZ Milevsko, kam Jan Koller 1994 mit 20 Jahren zu Sparta Prag, dem Serienmeister und Top-Verein seines Heimatlandes. Nachdem er sich in drei Jahren in Prag nicht durchsetzen konnte, wechselte er nach Belgien zum SK Lokeren. Hier entwickelte er sich weiter und wurde in der Saison 1998/99 mit 24 Treffern Torschützenkönig der ersten belgischen Liga. 1999 wechselte Koller von Lokeren zum belgischen Traditionsclub RSC Anderlecht, bei dem er zum internationalen Top-Stürmer reifte. In den zwei Spielzeiten 1999–2001 erzielte er 43 Tore für den RSC, wurde zweimal belgischer Meister und sammelte auch erste Erfahrungen in der Champions League. In der Saison 1999/00 wurde Jan Koller zum belgischen Fußballer des Jahres gewählt.