Emanuel Pogatetz (* 16. Jänner 1983 in Graz) ist ein österreichischer Fußballspieler auf der Position des Innenverteidigers. Er spielt für den LASK und die österreichische Nationalmannschaft.
Pogatetz begann seine Laufbahn im Nachwuchs des SK Sturm Graz, bei dem er im Mai 2000 auch seinen ersten Profivertrag unterzeichnete. Er wechselte noch im Sommer in die Erste Division zum FC Kärnten, mit dem er in seiner ersten Saison in die höchste Liga aufstieg und den ÖFB-Cup gewann. 2001 wurde der Linksfüßer von Bayer 04 Leverkusen verpflichtet und von dort zuerst an den FC Aarau und im Frühjahr 2003 an den Grazer AK verliehen. Mit dem GAK wurde er unter Trainer Walter Schachner österreichischer Meister und Cupsieger; zudem fand er dort seine angestammte Position links in der Viererkette. Im Frühjahr 2005 wurde er für einige Spiele an Spartak Moskau ausgeliehen.
In der Sommerpause 2005 unterschrieb Pogatetz beim englischen UEFA-Pokal-Starter FC Middlesbrough einen bis Juni 2010 laufenden Vertrag. Er fügte im Juni 2005 mit einem Foul dem russischen Spieler Jaroslaw Charitonski einen doppelten Beinbruch zu und wurde für zunächst 24 Spiele gesperrt. Bei einer weiteren Verhandlung wurde das Strafmaß auf acht Pflichtspiele gekürzt und Pogatetz wurde ein fixer Bestandteil des FC Middlesbrough, bei dem er trotz großer Konkurrenz zunehmend als linker Innenverteidiger eingesetzt wurde. Seit Saisonbeginn 2006 spielte er auf dieser Position. Am 31. Jänner 2006 traf er beim 3:0-Sieg gegen den FC Sunderland in der 19. Spielminute zum 1:0. Damit war er der erste Österreicher, der ein Tor in der englischen Premier League erzielte. Ab der Saison 2007/08 war er Mannschaftskapitän.